Mobile Suit Gundam se desarrolla cuando la guerra alcanza el hogar del adolescente Amuro Ray y hace añicos la vida que había conocido hasta entonces. En medio del caos, Amuro se sube al Gundam, la nueva arma secreta de la Federación Terrestre, y de algún modo logra hacerlo funcionar. Los combates lo obligan a subir a bordo del buque de guerra White Base, que lleva a Amuro y a otros refugiados lejos de su tierra natal mientras el conflicto se extiende a su alrededor.
Lo que comienza como una huida desesperada convierte al White Base en el centro de una lucha más amplia, librada por personas que nunca estuvieron destinadas a convertirse en soldados. Amuro está rodeado de niños y tripulantes sin experiencia como Bright Noa, Kai Shiden, Hayato Kobayashi, Frau Bow, Ryu Jose, Sayla Mass, Haro y, más tarde, Sleggar Law, mientras Char Aznable surge como una de las figuras más temibles del bando rival. A medida que el White Base pasa de un campo de batalla a otro, el papel de Amuro a los mandos del Gundam va mucho más allá de la simple supervivencia. La serie muestra cómo este improvisado grupo de refugiados, reclutas y jóvenes combatientes empieza a cambiar el curso de la guerra.