『The Great Passage』は、玄武出版の辞書編集部で働くベテラン編集者、Kouhei Arakiが、病気の妻の世話をするために退職を控えながら、最後の仕事として新しい辞書『The Great Passage』を完成させようとする物語である。だが、辞書作りには忍耐と時間、そして全力の献身が必要であるため、後任となる人物を見つけるのは容易ではない。
Arakiが行き着いたのは、玄武出版の営業部に勤める物静かな社員、Mitsuya Majimeである。彼は社交性に乏しく、多くの場面で空気を読むのが苦手だが、読書を愛することや、几帳面で丁寧な性格に支えられ、言葉に対して真摯な情熱を抱いている。Arakiはその素質を見抜き、辞書編集部への配属を持ちかける。Majimeはその役目を引き受けるものの、自分にその務めが果たせるのか、新しい同僚たちとうまくやっていけるのかに不安を抱く。だが、言葉という広大な海の中で、『The Great Passage』は、言語への共通の献身を通じて彼らを結びつけていく。