『鉄腕バーディー DECODE』では、宇宙連邦の豪放な捜査官バーディー・シフォン=アルティラが、異星人の逃亡犯ギーガーを追って地球へやって来る。標的が人間に変装し、ファッション業界に溶け込んでいたため、バーディーも同様にモデル事務所へ所属し、「有田しおん」という身分を名乗る。しおんとしては新進モデルとして撮影に臨む日々を送り、夜は星間犯罪者を追跡する。
一方、ごく普通の高校生である千川つとむは、友人とともに廃ビルを探検していた際、偶然バーディーのギーガー追跡に遭遇する。千川は二人の戦いを一瞬目撃するが、その後ギーガーに人質として捕らえられる。事態を知らないバーディーはギーガーに攻撃を仕掛け、その結果、誤って千川を死なせてしまう。自らの過ちに愕然とした彼女は、彼を救う唯一の手段として、彼の意識を自分の体に統合することを選ぶ。
こうして一つの体での同居を余儀なくされたバーディーと千川は、千川の高校生活、有田しおんとしてのモデル活動、そして宇宙連邦捜査官として次第に危険さを増していくバーディーの任務を両立させながら、ぎくしゃくした共同生活を送っていくのである。