Solo Levelingの舞台は、突如出現したゲートによって一変した世界である。ゲートは人類と、近代兵器が通用しない怪物がひしめく異次元をつなぐ門であり、人々は生き残るために、超人的な能力に目覚めた「ハンター」と呼ばれる者たちとなってその中へ入り、内部のダンジョンを攻略し、生活の基盤を築くギルドを組織していった。
物語の中心にいるのは、ソン・ジヌというE級ハンターで、「人類最弱のハンター」として知られる存在である。安全なはずのダンジョンで行われた討伐作戦の最中、彼と仲間たちは、さらに地下深くへ続く異様な通路を発見する。財宝の期待に引き寄せられるようにして闇へ踏み込んだ彼らは、想像を絶する恐怖と対峙することになる。ジヌは辛うじて惨事を生き延びるが、その経験ののち、彼だけに見える不可解なインターフェースを手にする。謎のシステムは彼がかねて求めていた力を与える一方で、その一歩ごとに代償を要求し、彼を危険な成長の道へと押し進める。それは、彼自身の運命とハンターたちの勢力図を変えかねないものである。