『月刊少女野崎くん』では、高校生の恋愛に締め切りやアシスタント業務、そして絶え間ない勘違いが絡み合う。佐倉千代は、無口で手の届かない存在に見える野崎梅太郎に恋をしているが、ようやく告白した際、野崎はその気持ちを自分の漫画への憧れと取り違え、夢野咲子名義で連載している少女漫画のアシスタントとして千代を起用する。このたった一つの勘違いによって、千代は野崎の風変わりな世界へと引き込まれ、何気ない学校生活が突然、脚本会議や作画の雑務、あるいは恋愛と現実がめったに同じ速度で進まないことを思い知らされる、滑稽な出来事へと変わっていく。
千代は野崎のそばにいようとし続けるうちに、同じくアシスタントの御子柴実琴や「学校の王子様」鹿島遊、さらに作品づくりに負けず劣らず手に負えない個性を持つ級友たちと関わるようになる。学校生活と漫画制作の間で、『月刊少女野崎くん』は、千代がいつか野崎に自分の気持ちが伝わることを信じてやまない姿を描きつつ、新たな交流のたびに周囲のコメディを深め、日常のひとときを大仰な恋愛的混乱へと変えていく。
