『まよチキ!』は、家族のプロレス好きな女性たちに鍛えられてきた結果、身体が人並外れて頑丈になった坂町近次郎を描く作品である。彼は強烈なパンチや蹴りはもちろん、車に跳ねられても平然としていられるが、その頑丈さには重大な弱点がある。女性恐怖症であり、女の子に触れられるだけで鼻血が止まらなくなったり、大量の汗をかいたり、突然気絶したりしてしまうのである。
そんな彼の慎重な日常は、学校のトイレでの運命的な出会いによって一変する。女の子から逃げようとした近次郎は、学園一の人気者であり、理事長の娘・涼月奏に仕える執事の近衛スバルが、実は女性であることを知ってしまう。スバルはこれに激しく反発して近次郎を叩きのめし、彼を気絶させる。さらに奇妙なのは、目を覚ました近次郎の前で奏が待っていたことである。奏は、スバルの秘密を守る代わりに、近次郎の女性恐怖症を治す手助けをすると持ちかける。
それ以来、近次郎はスバルの秘密、奏との取引、そして女の子との接触が常に災難につながりうる症状を抱えながら、日常を生き延びなければならない状況に追い込まれていく。