『Kuroneko to Majo no Kyoushitsu』では、スピカ・ヴァーゴは才能に恵まれていながらも実力が伴わない見習いで、名門ロイヤル・ダイアナ・アカデミーへの入学と、やがては憧れのクラウド・シリウスにふさわしい魔女になることを夢見ている。入学を許されるのは卓越した魔法の才能を持つ者だけで、卒業すれば魔法界の最高位、さらには王族の一員への道が開けるため、ひとつの席をめぐる競争は極めて激しい。スピカはその高みに届く野心を抱いているが、自力で地位を得るための人脈も経験も欠いている。
そんな彼女の運命は、並外れた魔力を持つ謎めいた黒猫と出会ったことで変わる。黒猫は、猫の姿に閉じ込めた呪いを解くのを手伝うなら教えてやると申し出る。取引として始まった関係は、やがて苛烈な師弟関係へと発展し、黒猫は過酷な訓練や試練を通してスピカに自分の弱さと可能性の両方に向き合わせる。呪いを解くために力を合わせる一方で、スピカはクラウド・シリウスへの憧れ、アカデミーへの入学という夢、そして最も才能ある魔法使いたちのために作られた世界で自分の居場所を証明しなければならないという厳しい現実のあいだで揺れる。ぎこちない協力関係は、あらゆる授業を信頼、規律、意志の強さを試す場へと変えていく。