『ヨルムンガンド』は、国際的な武器商人であるココ・ヘクマティアルを中心に描く。彼女は海運会社HCLIを通じて世界各地を飛び回り、法の追及をかわしながら戦線をまたいで武器を運んでいる。新たな護衛であるジョナサン・“ジョナ”・マルは、武器を、そしてそれを売る人間を嫌う少年兵だが、自分が憎む商売を営む女性を守らざるを得ない立場に置かれている。彼女の周囲には、主に特殊作戦部隊出身の元兵士で構成されたココの護衛チームがおり、それぞれが現場で培った戦闘経験を携えて、地元当局、国際機関、雇われた殺し屋の一歩先を行く任務に就いている。
銃撃戦と闇市場の取引の裏で、ココは一見不可能に思える夢、すなわち世界平和を追い求めている。しかし、その理想は、軍隊、民間軍事組織、民兵組織、情報機関がそれぞれ権力と生存を懸けて争う武器取引の現実と相容れない。CIAの工作員が迫り、行く先々で暗殺者が現れるなか、ジョナと他の仲間たちは、ココの描く未来が狂気なのか、操作なのか、それとも彼らを前へ進ませる唯一のものなのかを見極めなければならない。