別の物語は、病欠で学校の最初の1か月を休んだのち、夜見山北中学校の3年3組へ戻ってきた転校生・榊原 恒一を追う。彼は不在中に病院で出会った、眼帯をつけた物静かな少女・見崎 芽衣に、ほぼ即座に惹かれていく。問題は、新しいクラスメイトの誰一人として芽衣の存在を認めようとせず、代わりに「存在しないもの」に近づくなと彼に警告することである。 恒一は彼らの忠告を無視して芽衣と親しくなり、周囲の人々がなぜこれほど怯えているのかを少しずつ理解していく。
3年3組と、その中心にいる元生徒には陰惨な噂がつきまとっているが、その全容を 恒一 に語ろうとする者はいない。クラスを蝕む呪いがその影響力を強めるにつれ、奇怪な悲劇が次々と起こり始め、芽衣とこの災厄とのつながりも無視しがたくなっていく。日ごとに息苦しさを増す空気の中、 恒一、芽衣、そしてクラスメイトたちは教室の背後に潜む不気味な謎と向き合うことを余儀なくされ、あらゆる答えが重い代償へと近づくことを知る。
