En Yamada-kun y las siete brujas, Ryuu Yamada ingresa en el instituto Suzaku con la esperanza de dejar atrás su reputación de gamberro violento y empezar de cero. Sin embargo, cuando llega a segundo curso, ha recaído en sus viejos hábitos: saca muy malas notas, es perezoso y no deja de meterse en peleas.
Todo cambia cuando Ryuu conoce a Urara Shiraishi, una hermosa alumna brillante, y ambos caen accidentalmente por las escaleras y se dan un beso inesperado. Ese tropiezo revela una extraña habilidad: con un beso, la pareja puede intercambiar sus cuerpos, un poder que resulta a la vez útil y problemático mientras intentan entenderlo.
Poco después, Toranosuke Miyamura, miembro del consejo estudiantil y único integrante del Club de Estudios Sobrenaturales, los recluta. Más adelante se une Miyabi Itou, una estudiante excéntrica fascinada por lo sobrenatural, y juntos comienzan a desentrañar la leyenda de las Siete Brujas del instituto Suzaku, siete chicas que poseen distintos poderes activados con un beso. Su búsqueda arrastra a Ryuu a una vida escolar más extraña de lo que jamás imaginó.