Uchi no Otouto domo ga Sumimasen sigue a Ito, una estudiante de primer año de secundaria cuya vida cambia durante las vacaciones de primavera, cuando su madre vuelve a casarse y la familia se ve obligada a mudarse. De repente, Ito se encuentra viviendo bajo el mismo techo que cuatro hermanastros menores, y el hogar al que llega está lleno de rutinas desconocidas, silencios incómodos y el desafío cotidiano de integrarse en una familia completamente nueva.
Ito está decidida a llevarse bien con todos y a hacer que la convivencia funcione, incluso cuando el ambiente se siente tenso. La persona más difícil de entender es Gen, el hermano mayor, cuya actitud distante hace que resulte difícil descifrarlo. Sin embargo, a medida que Ito pasa más tiempo con sus nuevos hermanos, empieza a notar discretas muestras de calidez y amabilidad detrás de su fachada fría.
Con un equilibrio entre la comedia doméstica y delicados matices emocionales, Uchi no Otouto domo ga Sumimasen se centra en las fricciones, la confianza y la cercanía gradual que pueden surgir dentro de una familia reconstituida, mientras Ito aprende a encajar en una casa que ya no es del todo suya.