En Tsuki ga Kirei, los compañeros de secundaria Kotarou Azumi y Akane Mizuno se conocen de verdad por primera vez en su tercer y último año. Kotarou aspira a ser escritor, mientras que Akane forma parte del equipo de atletismo, y al principio ambos son completos desconocidos. Al ser asignados a encargarse del material para el festival deportivo en Kawagoe, pasan de encuentros casuales e incómodos a mensajes privados por LINE, y una curiosidad silenciosa va dando paso poco a poco a los primeros sentimientos amorosos. Los días normales de escuela empiezan a sentirse distintos a medida que cada pequeño intercambio adquiere un nuevo significado.
A medida que su relación empieza a tomar forma, Kotarou y Akane se enfrentan a la emoción y la incertidumbre del primer amor, incluida su propia indecisión, unos sentimientos que todavía están aprendiendo a comprender y la atención de quienes los rodean. Takumi lleva mucho tiempo sintiendo algo por Akane, y Chinatsu Nishio empieza a interesarse por Kotarou, lo que complica el frágil espacio entre ambos protagonistas. Bajo el resplandor de una hermosa luna llena, la serie se detiene en esos momentos pequeños y delicados que definen el afecto juvenil, desde la expectación nerviosa hasta el valor necesario para expresar lo que sienten. Tsuki ga Kirei presenta el romance como una delicada historia de maduración, emocionalmente sincera, sobre la conexión, la vulnerabilidad y el poder transformador del amor.