Tomodachi Game sigue a Yuuichi Katagiri y a sus compañeros de clase más cercanos después de que desaparece el dinero para su viaje escolar y la confianza entre ellos empieza a resquebrajarse. Poco después, Yuuichi y los demás son secuestrados y despiertan en una habitación cerrada, donde se ven obligados a participar en una serie de crueles juegos destinados a saldar una gran deuda y sacar a la luz los sentimientos ocultos que permanecen enterrados en el grupo.
Guiado por el inquietante Manabu-kun, cada prueba empuja a los compañeros de clase más hondo en la sospecha, la manipulación y la traición. A medida que avanzan los juegos, Yuuichi debe decidir en quién puede confiar, hasta dónde puede llegar la lealtad y si la honestidad sigue teniendo cabida cuando cada respuesta puede volverse en su contra. En lugar de apoyarse en la fuerza bruta, Tomodachi Game construye su tensión mediante alianzas cambiantes, presión emocional y la forma en que la amistad puede retorcerse hasta convertirse en un instrumento de control, transformando un simple desastre de viaje escolar en una implacable batalla psicológica.