En Star Driver, Southern Cross Isle oculta una guerra secreta bajo su tranquila apariencia. La Brigada Glittering Crux busca los Cybodies, antiguos gigantes de piedra que solo pueden ser despertados en la dimensión sellada de Zero Time. Su plan depende de romper los sellos custodiados por cuatro doncellas del sello, lo que permitiría a los Cybodies cruzar al mundo real y daría a la Brigada el control del poder oculto de la isla.
Cuando Takuto Tsunashi llega a la isla tras naufragar, queda rápidamente arrastrado a ese conflicto tras conocer a Sugata Shindou y Wako Agemaki. Se matricula en la academia local, donde las clases corrientes y la vida de los clubes se entrelazan con lealtades secretas, y muchos de sus compañeros están vinculados de una u otra forma a Glittering Crux. A medida que Takuto descubre que puede pilotar el Cybody Tauburn en Zero Time, se convierte en una figura clave en la lucha por el sello de Wako y por los misterios enterrados bajo Southern Cross Isle.
Combinando acción mecha, drama escolar e imágenes surrealistas, Star Driver sigue a facciones rivales, identidades ocultas y la frontera inestable entre la vida cotidiana y las fuerzas sobrenaturales que modelan la isla.
