Sounan desu ka? sigue a Homare Onishima, Shion Kujou, Asuka Suzumori y Mutsu Amatani después de que un viaje escolar sale terriblemente mal y las deja varadas en una isla desierta. Mientras Shion, Asuka y Mutsu están aterradas y desesperadas, Homare permanece extrañamente calmada, porque no es la primera vez que tiene que valerse por sí misma para sobrevivir.
Criada por un padre experto en supervivencia y entrenada por todo el mundo desde la infancia, Homare sabe escalar acantilados, cazar presas con trampas, construir refugios y encontrar comida en lugares que la mayoría consideraría imposibles, incluidos los célebres testículos de alce, que ya ha aprendido a comer. Para ella, sobrevivir en una isla deshabitada con solo una remota posibilidad de rescate es cosa de niños. El verdadero reto es evitar que sus tres compañeras entren en pánico.
Mientras Homare guía sin pudor a las chicas por los aspectos más delicados de la supervivencia, como beber sangre de pez y comer cigarras, las compañeras varadas poco a poco empiezan a adaptarse. Lo que comienza como una pesadilla se convierte en un absurdo curso intensivo de resistencia e ingenio, y las chicas descubren que la vida en la isla puede ser más extraña, más dura y mucho más llevadera de lo que jamás imaginaron.