Sirius the Jaeger se desarrolla en 1930, cuando los vampiros se han infiltrado en Tokio y han comenzado a alimentarse de ciudadanos desprevenidos. A medida que aumenta el número de víctimas, las autoridades de la ciudad contratan a los Jaegers, un grupo extraño y variado encargado por la compañía V Shipping de cazar vampiros por todo el mundo. Viajan con estuches de instrumentos musicales para ocultar sus armas y su identidad, y, cuando comienza el combate, responden a sus enemigos con la misma crueldad que los vampiros muestran a sus víctimas.
En el centro de la historia está Yuliy, el guerrero más hábil de los Jaegers y el único superviviente de una incursión de vampiros en su aldea natal. Dotado por su sangre de hombre lobo, trabaja junto al resto del equipo en su aparente esfuerzo por ayudar a la policía de Tokio, aunque su verdadera misión es mucho más peligrosa. Los Jaegers persiguen el místico Arca de Sirius, un artefacto que, según se dice, posee el poder de cambiar el destino del mundo. Con los vampiros tras el mismo premio con fines destructivos, Yuliy y sus aliados deben encontrar el Arca antes de que sus enemigos puedan hacerse con ella.
