Silent Witch se centra en Monica Everett, una maga prodigiosa del Reino de Ridill que se convirtió en la primera persona en dominar la magia sin conjuros. Como una de los Siete Sabios, posee poder suficiente para enfrentarse a amenazas aterradoras, incluido el legendario dragón negro, y derrotarlas por sí sola. Pero la mayor fortaleza de Monica está ligada a una debilidad aún más profunda: es extremadamente tímida, y aprendió a lanzar hechizos sin recitar conjuros porque prefiere evitar hablar en público antes que impresionar a nadie. Si pudiera elegir, viviría encantada sola en la cima de una montaña, lejos de la sociedad.
Ese aislamiento termina cuando otro sabio le encomienda en secreto una misión para proteger al segundo príncipe del reino, Felix Arc Ridill, tras una serie de intentos de asesinato. Para mantenerlo a salvo, Monica debe matricularse de incógnito en la Academia Serendia, donde oculta tanto su identidad como su ansiedad social tras la fachada de una estudiante corriente. Entre la vigilancia encubierta, los nervios constantes y la presión de convivir con compañeros que no saben nada de su verdadero papel, Monica afronta una misión mucho más difícil que cualquier hechizo: sobrevivir al día a día sin revelar quién es en realidad.