Seitokai no Ichizon se centra en Ken Sugisaki, vicepresidente del consejo estudiantil de la Academia Hekiyou, quien se abre paso hasta el único puesto libre al subir lo suficiente sus notas en los exámenes para cumplir con los requisitos. Ken ha pasado toda su vida escolar imaginando las tareas del consejo estudiantil como un paraíso harem despreocupado, lleno de bocadillos, juegos y días rodeado de hermosas chicas que lo adoran, pero la realidad es mucho menos romántica. La sala del consejo en la que entra es estrecha, caótica y está dominada por chicas mucho más interesadas en mantener la academia en funcionamiento que en dejarse llevar por sus ensoñaciones.
En la Academia Hekiyou, la mayoría de los miembros del consejo se eligen por votación popular, mientras que uno de los puestos se reserva para el estudiante con la mejor puntuación, y Ken se cuela en ese papel con poca idea de lo exigente que va a ser. El resto del consejo sigue ignorando sus intentos de acercamiento mientras se ocupa de los eventos escolares, los asuntos de los clubes y el trabajo ordinario que mantiene en orden la vida estudiantil. Cada reunión se convierte en un choque entre los deseos de Ken y las responsabilidades prácticas del consejo, con personalidades obstinadas, diálogos rápidos y una fricción constante entre fantasía y deber que impulsa la comedia.
