Seiken Tsukai no World Break sigue a la Academia Privada Akane, donde los estudiantes que recuerdan sus vidas anteriores se entrenan en las Artes Ancestrales para defender al mundo de los Metaphysicals, monstruos que aparecen sin previo aviso. Estos salvadores se dividen en dos grupos: los kurogane, que canalizan prana para invocar armas ofensivas, y los kuroma, que usan magia.
Moroha Haimura entra en ese mundo como un estudiante aparentemente normal, pero su vida cambia durante la ceremonia inaugural del curso, cuando conoce a Satsuki Ranjou. Ella recuerda una vida pasada en la que era su hermana pequeña, mientras que Moroha era un príncipe heroico cuyas habilidades con la espada podían derrotar ejércitos enteros. Poco después, cruza su camino con Shizuno Urushibara, que lo reconoce de otra encarnación completamente distinta: en esa vida, Moroha era un señor oscuro con un poder mágico devastador, pero aun así la спасó de una vida de esclavitud.
A medida que afloran recuerdos de dos vidas muy distintas, Moroha se ve obligado a enfrentarse al vínculo entre el presente y el pasado mientras la academia continúa su lucha contra los Metaphysicals. La serie combina vida escolar, combates de fantasía y un drama impulsado por la reencarnación en torno a la pregunta de qué futuro puede construirse cuando las viejas identidades se resisten a desaparecer.