En Sabage-bu!, Momoka Sonokawa empieza su nueva vida en la escuela secundaria con un trayecto de pesadilla: en el tren hacia el colegio, un acosador la toma como objetivo y una chica armada con dos pistolas la rescata. Esa chica es Miou Ootori, alumna de un curso superior de Momoka y presidenta del Club de Juegos de Supervivencia de la Academia Aogiri, conocido abreviadamente como Sabage-bu. Al darse cuenta de la facilidad de Momoka con una pistola, Miou decide que la quiere en el club y no deja de insistirle para que se una. Aunque al principio Momoka se niega, acaba formando parte de Sabage-bu de algún modo.
Lo que Momoka encuentra dentro del club dista mucho de ser normal. Sabage-bu no tiene nada de un club típico de escuela secundaria, y el comportamiento socialmente torpe de sus miembros la incomoda desde el principio. Sus personalidades van desde lo fanático hasta lo completamente delirante, y sus disparates llevan la vida escolar al terreno del absurdo. No dudan en deambular por espacios públicos vestidos con trajes de ghillie o incluso en lanzarse al puenting desde el edificio de la escuela. Atrapada junto a esta colección de fanáticos de los juegos de supervivencia, Momoka, que en apariencia es una chica corriente, tiene que adaptarse a una vida escolar caótica, extraña y mucho más salvaje de lo que jamás imaginó.