Rosario to Vampire comienza con Tsukune Aono, un chico corriente que, por accidente, termina en la Academia Youkai, un centro de estudios oculto donde los monstruos viven bajo reglas estrictas y se supone que los humanos no existen en el campus. Como escapar significaría perder la única escuela que lo aceptó, Tsukune se ve obligado a enfrentarse a las clases, las rivalidades y el riesgo constante de ser descubierto como humano mientras intenta encontrar su lugar en un mundo hecho para lo sobrenatural. Cada encuentro en un pasillo puede convertirse en un duelo, un malentendido o una prueba de cuánto tiempo puede mantener intacto su secreto, y las normas ocultas de la academia, la hostilidad hacia los humanos y la política entre monstruos mantienen la historia en un vaivén entre la comedia y el peligro.
Quien lo sumerge más profundamente en ese mundo es Moka Akashiya, una vampira cuyo rosario sella un lado mucho más peligroso. A su alrededor, el grupo sigue creciendo: Kurumu Kurono, una súcubo seductora; Yukari Sendou, una joven bruja de notable talento mágico; y Mizore Shirayuki, una yuki-onna reservada cuyo exterior frío oculta un apego obstinado. Sus choques, amistades y malentendidos convierten la vida en la academia en una mezcla de comedia escolar, acción y caos de harén, con Tsukune atrapado en medio de cada desastre sobrenatural.