Prince of Stride se centra en el stride, un deporte extremo de relevos que combina parkour, freerunning, carreras de velocidad y estrategia de equipo. Atraída por la reputación de la Academia Honan, Nana Sakurai, alumna de primer curso, se matricula con la esperanza de unirse al equipo de stride de la escuela. Pronto descubre que Takeru Fujiwara, otro alumno de primer curso y devoto aficionado al stride, persigue el mismo objetivo. Sus planes se ven truncados cuando descubren que el club de stride ha quedado inactivo y ahora funciona bajo el club de shōgi, porque no tiene suficientes miembros para operar por sí solo.
Negándose a dejar que el equipo desaparezca, Nana y Takeru se proponen reconstruirlo. Reclutan a Riku Yagami, un corredor talentoso que muestra interés por casi todos los deportes, y empiezan a reunir un grupo capaz de recuperar el antiguo esplendor de Honan. Con la competición End of Summer a la vista, el nuevo club debe entrenar duro, recuperar su espíritu y demostrar que el equipo de stride de Honan puede resurgir. Prince of Stride sigue su empeño por convertir un club dormido en un equipo competitivo, equilibrando velocidad, rivalidad y los vínculos que surgen al perseguir un objetivo compartido.