Nippon Sangoku está ambientada en un Japón de un futuro cercano que ha colapsado bajo el peso combinado de la guerra nuclear, los desastres naturales repetidos y la corrupción sistémica. A raíz de esa devastación, el país queda dividido en tres superpotencias en guerra, dando inicio a un brutal período moderno de los Tres Reinos. La diplomacia ha desaparecido; cada territorio sobrevive gracias a su fuerza militar, y la lucha por los escasos recursos convierte la tierra que queda en una batalla constante por el control.
En el centro de ese conflicto está Aoteru Misumi, un funcionario de bajo rango que ha pasado la mayor parte de su vida en un segundo plano. Aunque carece tanto de un linaje militar prestigioso como de una familia aristocrática, posee una férrea determinación de poner fin al derramamiento de sangre inútil que consume a la nación. Armado con una aguda perspicacia y una voz persuasiva capaz de reunir a la gente a su alrededor, Misumi se propone desafiar la estructura de poder que mantiene viva la guerra.
Nippon Sangoku sigue el ascenso de un hombre que cree que la unificación aún es posible incluso en un país regido por la fuerza y el agotamiento. A medida que las alianzas cambian y la supervivencia se vuelve cada vez más precaria, su intento de unir a la nación fragmentada se convierte en una prueba de convicción, estrategia y voluntad.