Nana se centra en dos jóvenes que comparten el mismo nombre, pero llegan a Tokio con expectativas muy distintas sobre el futuro. Nana Komatsu es alegre, cariñosa e irremediablemente romántica, pero su tendencia a confiar demasiado pronto ha hecho que su vida sentimental sea inestable. Decidida a no dejar atrás a su novio de confianza, Shouji Endo, trabaja para ahorrar suficiente dinero y seguirlo a la capital para empezar una nueva vida.
Nana Osaki, por su parte, es una vocalista punk solitaria impulsada por un intenso deseo de triunfar en la música. Su apasionada relación con Ren Honjou, el bajista de su banda, termina de forma repentina, dejándola con el corazón roto, pero aún decidida a perseguir su sueño de convertirse en una artista reconocida. Lejos de retirarse, se marcha a Tokio con la determinación de construir un futuro a su manera.
Una coincidencia inesperada vuelve a cruzar las vidas de las dos Nanas, y pronto terminan viviendo bajo el mismo techo. A partir de entonces, se convierten en una presencia constante en la vida de la otra, ofreciéndose apoyo, sinceridad sin rodeos y una sensación de estabilidad mientras afrontan el amor, la ambición y la incertidumbre de la vida en la ciudad. Nana sigue el crecimiento de su amistad al tiempo que enfrentan sus dificultades, convirtiendo su apartamento compartido en un pequeño refugio en un mundo en el que ambas todavía tratan de encontrar su lugar.