Myself; Yourself sigue a Sana Hidaka, quien deja la tranquila localidad de Sakuranomori por Tokio cuando los planes empresariales de sus padres lo apartan de los amigos con los que creció. Antes de irse, se despide de Aoi Oribe, los gemelos Wakatsuki Shuri y Shuusuke, y la cálida y afectuosa Nanaka Yatsushiro, llevándose consigo la promesa de que el vínculo entre ellos perdurará incluso con el paso de los años.
Cinco años después, Sana regresa con 16 años con la esperanza de recuperar los días corrientes que dejó atrás y reencontrarse con las personas que en su momento dieron forma a su mundo. Sin embargo, se encuentra con un lugar de origen a la vez familiar y cambiado: las amistades han tomado rumbos distintos, los sentimientos que nunca se expresaron del todo permanecen latentes bajo las conversaciones cotidianas, y cada uno de sus antiguos amigos ha ido cargando en silencio con sus propios problemas. El reencuentro obliga a Sana a enfrentarse a cuánto ha transformado el tiempo al grupo y a lo frágiles que pueden volverse las promesas de la infancia cuando se dejan solo en manos de la memoria.
Con una mezcla de nostalgia, romance y drama emocional, Myself; Yourself recorre el difícil camino de regreso a la confianza mientras Sana y los demás deciden si los lazos formados en la niñez todavía pueden perdurar en el presente.