En 1973, tras la despiadada Guerra Lunar de seis años, la especie alienígena hostil conocida como los BETA —seres de origen extraterrestre, adversarios de la raza humana— invadió la Tierra, matando a miles de millones y diezmando Eurasia. Aunque los BETA pueden ser destruidos con armas convencionales, su clase láser puede aniquilar flotas enteras de aeronaves, lo que obligó a la humanidad a desarrollar enormes trajes de combate llamados Tactical Surface Fighters (TSF) para combatirlos.
Cuando los BETA llegan a Japón en 1998, la estudiante de escuela militar y piloto de TSF —o eishi— Yui Takamura recibe la orden de defender la última línea defensiva de Kioto junto a sus compañeros de clase. A costa de incontables vidas humanas y del sacrificio de los compañeros de Yui, el Ejército Imperial Japonés logra repeler a los invasores, dejando la destrucción a su paso. Sin embargo, este encuentro deja a Yui decidida a no permitir que algo así vuelva a ocurrir.
Tres años después, ya teniente, Yui se une al proyecto XFJ, un programa de desarrollo de TSF Japón-Estados Unidos con base en Alaska. En un equipo internacional compuesto por el poco cooperativo piloto de pruebas japonés-estadounidense Yuuya Bridges y varios eishi procedentes de países perdidos frente a los BETA, la tarea de Yui es ayudar a desarrollar el nuevo TSF japonés, el Shiranui. En medio de tensiones políticas heredadas de la Guerra Fría, Muv-Luv Alternative: Total Eclipse sigue la delicada misión de Yui y el viaje de Yuuya para superar los demonios del pasado que aún lo atormentan.
[Escrito por MAL Rewrite]
