Marika-chan no Koukando wa Bukkowareteiru se centra en un chico poco popular que por fin reúne el valor suficiente para confesarle su amor a Marika, su amiga de la infancia, solo para verse arrastrado a una situación que apenas puede explicar. Tras pedir un deseo a una estrella fugaz, despierta con una extraña habilidad nueva: puede ver un medidor oculto del amor flotando sobre las personas, como si la vida real se hubiera convertido en un simulador de citas. Cuando mira a Marika, el medidor está tan bajo que parece completamente averiado, aunque su comportamiento hacia él sigue siendo cálido, atento e imposible de interpretar.
Esa contradicción lo lleva a desesperarse por saber si la lectura refleja sus verdaderos sentimientos o si no es más que mala suerte de su parte. Mientras pone a prueba los límites de su nuevo poder, cada conversación con Marika se convierte en un intercambio incómodo, lleno de esperanza, vergüenza y segundas oportunidades. Marika-chan no Koukando wa Bukkowareteiru convierte esa incertidumbre en su conflicto central y se pregunta si el amor puede sobrevivir al mal momento, a las señales contradictorias y a un corazón que se niega a tener sentido.