Love Hina sigue a Keitarou Urashima, quien de niño hizo la promesa de ingresar en la Universidad de Tokio y reencontrarse con una chica que conoció años atrás. A los 20 años, después de suspender dos veces el examen de admisión, queda atrapado entre la vergüenza y la determinación, sin saber si persigue un sueño o se aferra a un recuerdo. Con la esperanza de que un nuevo comienzo le ayude a estudiar, se dirige a la posada de su abuela, solo para descubrir que la Posada Hinata se ha convertido en una residencia femenina.
Allí, Keitarou se ve inmerso en la vida cotidiana con cinco residentes muy distintas: Naru Narusegawa, una chica perspicaz y ambiciosa que también aspira a ingresar en la Universidad de Tokio; Mitsune Konno, una escritora freelance traviesa y de espíritu despreocupado; Kaolla Su, una ingeniera enérgica con talento para provocar el caos; Shinobu Maehara, una chica tímida que intenta encontrar su lugar; y Motoko Aoyama, una seria entusiasta del kendo que mira con malos ojos su llegada. Aunque la primera impresión dista mucho de ser acogedora, Keitarou termina encargándose del edificio y, poco a poco, pasa a formar parte del hogar.
A medida que se acumulan el romance, los malentendidos y las personalidades enfrentadas, Love Hina equilibra la comedia con la historia de un joven que intenta cumplir una promesa de la infancia mientras aprende lo complicado que puede ser crecer.