En Level E, Yukitaka Tsutsui, un estudiante nacido en Tokio, se muda a la prefectura de Yamagata para cursar el bachillerato gracias a una beca de béisbol. Como provenía de la secundaria con mejor nivel de béisbol de Japón, los habitantes del pueblo esperan con impaciencia su llegada. Pero, en lugar de un comienzo tranquilo, Yukitaka encuentra a un hombre extraño en su apartamento, leyendo con toda naturalidad e incluso vistiendo su ropa. El intruso afirma ser un alienígena que se estrelló en la Tierra y no tiene adónde ir, y luego revela que en realidad es Baka Ki El Dogra, el príncipe heredero del planeta Dogra. No es más que uno de los cientos de alienígenas que ya han hecho de la Tierra su hogar, sin que la mayoría de los humanos lo sepa.
A pesar de su origen real, el príncipe es un infame necio intergaláctico al que no le importa causar molestias a los demás con tal de divertirse. Somete a sus subordinados a pruebas absurdas, concede poderes extraños a niños escogidos al azar y convierte la vida cotidiana en una sucesión de bromas y desastres cada vez mayores. A medida que Yukitaka y todos los que lo rodean se ven arrastrados a sus planes, nadie se libra de las payasadas del príncipe idiota.