Chrome Shelled Regios se desarrolla en un mundo posapocalíptico asolado por bestias mutadas conocidas como Limbeekoon, o monstruos de la inmundicia, donde la humanidad sobrevive dentro de enormes ciudades móviles llamadas Regios. Para protegerse, las personas se entrenan para empuñar unas armas especiales llamadas Dite, canalizando en combate el poder del Kei. En la ciudad académica de Zuellni, Layfon Alseif intenta empezar de nuevo y dejar atrás su pasado, pero la vida que desea dista mucho de ser sencilla. Karian Loss, el manipulador presidente del consejo estudiantil, se interesa por él, y Nina Antalk, una estudiante de Artes Militares que ejerce como capitana del 17.º pelotón de Artes Militares, reconoce de inmediato las extraordinarias capacidades de Layfon y cree que pertenece a su grupo. Mientras Layfon se adapta a Zuellni, los secretos ligados a su historia se resisten a permanecer enterrados. Sus poderes desconocidos y el peso del pasado del que intenta huir lo convierten en una figura a la vez prometedora y peligrosa, arrastrándolo a la política, el combate y las rivalidades de la ciudad. Con la supervivencia de la humanidad siempre en juego, las decisiones de Layfon pueden determinar algo más que su propio futuro.