En Kobato., Kobato Hanato es una chica amable y sincera que anhela llegar a un lugar concreto, cueste lo que cueste. Para ganarse esa oportunidad, se la envía a ayudar a las personas cuando atraviesan momentos difíciles. Cada vez que sana un corazón roto, aparece un pequeño fragmento parecido a un caramelo que se añade a una botella especial; cuando por fin se llene, su deseo se hará realidad.
Acompañada por su compañero de peluche Ioryogi, Kobato va pasando de un problema cotidiano a otro y conoce a personas cuyos problemas, aunque no son grandes, sí son profundamente personales. Algunos están atrapados en conflictos familiares, como un niño que tiene problemas con sus padres; otros, como una chica de instituto preocupada por el romance, se ven absorbidos por inquietudes privadas que para ellos resultan abrumadoras. Episodio tras episodio, la sonrisa luminosa de Kobato, su sincera dulzura y su carácter naturalmente extrovertido aportan consuelo a quienes la rodean, transformando los encuentros cotidianos en discretos actos de sanación. A medida que la botella se va llenando lentamente, su bondad se convierte en el corazón de la serie, enlazando cada nuevo problema con la promesa más amplia vinculada a su deseo.
