En Kaze no Stigma, Kazuma Yagami es un usuario de Fuujutsu, la habilidad de controlar el viento, que regresa al noble clan Kannagi tras cuatro años de exilio. Expulsado por su incapacidad para controlar el fuego y por su derrota en un duelo contra su prima menor, Ayano Kannagi, Kazuma vuelve a un hogar que tiene motivos de sobra para odiarlo. El resentimiento de la familia no hace sino intensificarse cuando varios miembros de los Kannagi aparecen asesinados mediante Fuujutsu, lo que lo convierte en el sospechoso más obvio.
Con el temperamento impulsivo de Ayano a la cabeza, Kazuma se ve obligado a enfrentarse al mismo clan que una vez lo desterró mientras demuestra que no tuvo nada que ver con los asesinatos. Lo que comienza como un amargo regreso al hogar pronto se convierte en una lucha por la lealtad, el orgullo y el peligroso poder que rodea al linaje Kannagi. A medida que se acumulan las acusaciones, Kazuma no solo debe limpiar su nombre, sino también trabajar junto a la familia con la que comparte un odio mutuo para descubrir al verdadero culpable. La tensión entre el viento y el fuego, entre el exilio y el deber, define el conflicto sobrenatural de la serie y el vínculo incómodo entre Kazuma y Ayano.