En Ima, Soko ni Iru Boku, Shuuzou “Shuu” Matsutani va dejando pasar una vida corriente marcada por sus amigos, un amor platónico y el kendo, hasta que una derrota ante su rival lo lleva al atardecer a una chimenea, donde conoce a Lala-Ru, una chica callada de cabello azul que lleva un extraño colgante. Shuu intenta ganarse su confianza incluso cuando sus respuestas son frías y distantes, pero ese breve encuentro se rompe cuando una mujer y dos máquinas con forma de serpiente aparecen de la nada para apoderarse de Lala-Ru. Shuu corre a protegerla y termina arrastrado a un mundo desértico, muy alejado de todo lo que conoce.
Allí, la supervivencia está regida por la escasez y la violencia. El colgante de Lala-Ru puede invocar agua, un milagro en una tierra donde ese recurso es precioso, y cuando desaparece, Shuu pasa a ser el principal sospechoso. Arrojado a un paisaje hostil de soldados, cautiverio, tortura y hambre, se ve obligado a soportar los horrores de la guerra mientras se aferra a la esperanza de salvar a la solitaria chica que conoció en lo alto de la chimenea. Ima, Soko ni Iru Boku pasa del impacto del secuestro a una lucha sombría por la empatía, la supervivencia y la decencia humana en un mundo que ofrece muy poco de todo ello.