Hikaru no Go comienza cuando Hikaru Shindou, un escolar con poco interés por los juegos de mesa, descubre un antiguo tablero de go en el ático de su abuelo y despierta al espíritu de Fujiwara no Sai, un consumado jugador de go de la Era Heian que en su día sirvió como instructor del emperador de Japón. Sai ha pasado siglos esperando la oportunidad de cumplir su sueño inconcluso de alcanzar un nivel divino de go que ningún jugador ha logrado jamás, y, como no tiene cuerpo propio, solo puede perseguir ese objetivo guiando las manos de Hikaru sobre el tablero.
Lo que empieza como una cooperación a regañadientes pronto sumerge a Hikaru en el mundo del go competitivo. Con la guía de Sai, va descubriendo la profundidad, la presión y el orgullo que dan forma al juego, mientras poco a poco descubre sus propios instintos y la satisfacción de ganar a su manera. Ese camino se vuelve aún más intenso cuando conoce a Akira Touya, un brillante joven prodigio cuya habilidad y determinación lo convierten en el rival más feroz de Hikaru. Atrapado entre la ambición de Sai, el desafío de Akira y su propio deseo de demostrarse a sí mismo, el crecimiento de Hikaru se convierte en una historia de maduración cimentada en la rivalidad, la disciplina y la determinación de hacerse un lugar en el tablero por derecho propio.