Hatsukoi Monster comienza con Kaho Nikaidou, una estudiante de primer curso procedente de una familia influyente que ha pasado toda su vida protegida incluso del más mínimo insulto, porque la gente teme la ira de su familia. Con la esperanza de vivir entre compañeros que la traten como a una más, deja su casa para ir a una residencia cuando empieza en un nuevo instituto. Poco después de llegar, se pierde entre el tráfico y la rescata un desconocido alto y apuesto. Cuando le pregunta su nombre, él la llama rara y se marcha. Ese único y duro comentario basta para que Kaho se enamore perdidamente de él.
Cuando vuelve a encontrarse con su salvador, descubre que se llama Kanade Takahashi y le confiesa sus sentimientos. Kanade acepta que puedan ser pareja, pero le advierte de que quizá no quiera salir con él cuando conozca su secreto. Para su asombro, Kaho descubre la verdad: Kanade está en quinto de primaria.
Kaho decide que no puede salir con un niño de quinto de primaria e intenta poner fin a la relación, pero cuanto más tiempo pasa con Kanade, más se encariña con él. Hatsukoi Monster sigue los primeros pasos de Kaho en el amor mientras navega por el vínculo absurdo, confuso y sorprendentemente tierno que forma con su inmaduro pero amable novio de quinto de primaria.