Handa-kun sigue a Sei Handa, un prodigio de la caligrafía en el instituto convencido de que todos a su alrededor le odian. En realidad, es el alumno más admirado del centro, conocido por su inigualable caligrafía, su llamativo atractivo y su aplomo inquietante. Como Handa interpreta cada gesto como una burla o una mofa, los elogios que recibe de sus compañeros no hacen sino empujarlo aún más al aislamiento, incluso mientras intenta mantenerse alejado de las personas que lo idolatran. Cuanto más evita Handa llamar la atención, más atención recibe. Compañeros y admiradores lo rodean, convencidos de que cada reacción incómoda y cada comentario accidental solo demuestra lo excepcional que es. Modelos de moda, delincuentes recluidos, fanáticas obsesivas y otros excéntricos se ven arrastrados al caos, convirtiendo la vida escolar cotidiana en una cadena incesante de malentendidos cada vez mayores. La comedia de Handa-kun nace de la distancia entre la imagen que Handa tiene de sí mismo y el culto a la personalidad que se ha formado a su alrededor, mientras sus desesperados intentos por desaparecer lo vuelven todavía más imposible de ignorar.
