Gugure! Kokkuri-san sigue a Kohina Ichimatsu, una chica que se autoproclama muñeca y cuya vida tranquila y sin sobresaltos se vuelve extraña en el momento en que invoca a un espíritu zorro llamado Kokkuri-san. Según la leyenda, Kokkuri-san debería ser una presencia omnisciente capaz de responder preguntas y guiar a quienes lo llaman, pero en la época actual la pérdida de creyentes lo ha dejado sin poder y lejos de la figura misteriosa que la gente espera.
Lo que encuentra, en cambio, es a Kohina: una chica extraña y solitaria que vive sola y parece sobrevivir únicamente a base de ramen instantáneo. Sorprendido por sus hábitos y preocupado por su bienestar, Kokkuri-san decide quedarse con ella y hacerse cargo de su vida diaria, procurando que coma bien y viva en condiciones dignas. Su improbable hogar se convierte enseguida en una sucesión de situaciones incómodas, absurdas y, de algún modo, entrañables, mientras Kokkuri-san se esfuerza sin demasiado éxito por actuar como cuidador y Kohina sigue tan excéntrica como siempre. El resultado es una comedia peculiar construida en torno a la vida doméstica sobrenatural, el humor seco y la rutina inestable que comparten un espíritu zorro y la chica que lo invocó.
