Glasslip sigue a Touko Fukami, una silenciosa estudiante de instituto de Fukui que procede de una familia de artesanos del vidrio y sueña con convertirse en una artista del vidrio por derecho propio. Mientras avanza por el tramo final del verano, breves destellos de imágenes del futuro y voces sin cuerpo empiezan a irrumpir en sus días normales, dejándola con la sensación de que algo en el mundo está a punto de cambiar. Lo que debía ser una estación tranquila se va impregnando poco a poco de incertidumbre, y Touko se ve obligada a convivir con impresiones que no puede explicar ni controlar.
En el verano en que cumple dieciocho años, esa inquietud se intensifica cuando el estudiante transferido Kakeru Okikura llega a su escuela y después vuelve a aparecer en Kazemichi, la cafetería favorita de Touko, junto con sus cuatro amigos. Las voces del futuro parecen atraer a Kakeru hacia ella, y su presencia altera el ritmo apacible que ha construido con quienes la rodean. Glasslip sigue a los seis amigos a lo largo de un verano memorable marcado por la esperanza, el afecto, la confusión y las pequeñas penas que conlleva acercarse más unos a otros.