Colorful comienza en una estación de tren de la muerte, donde un alma impura recibe inesperadamente, en contra de su voluntad, una segunda oportunidad de vivir. Reencarnada en el cuerpo de Makoto Kobayashi, un chico de 14 años que se ha suicidado recientemente, el alma recibe una cruel misión: en un plazo de seis meses, debe identificar el mayor pecado del muchacho y demostrar que ha merecido la oportunidad de seguir adelante.
Obligada a vivir como Makoto, al principio el alma se resiste a la idea de continuar la vida en su lugar, pero las experiencias cotidianas van revelando poco a poco lo complejas que pueden ser las emociones y las acciones de las personas. A medida que Colorful sigue ese difícil proceso de adaptación, va descubriendo las familias fracturadas, la vergüenza íntima y el dolor oculto que dan forma al mundo que lo rodea. Lo que empieza como un castigo se convierte gradualmente en una lección de empatía, y muestra cómo los momentos más corrientes pueden sacar a la luz el peso que las personas cargan en silencio.
En lugar de ofrecer respuestas fáciles, Colorful aborda de frente el suicidio y las dificultades cotidianas a las que se enfrentan los seres humanos, pero que se sienten demasiado avergonzados para afrontar, convirtiendo una vida prestada en una meditación sobre el arrepentimiento, la conexión y las frágiles razones para seguir adelante.