Laputa: El castillo en el cielo sigue a Sheeta, una chica cuyo amuleto de cristal atrae la atención de los militares y del coronel Muska, un agente del gobierno decidido a desentrañar los secretos del reino flotante de Laputa. Tras escapar de un ataque a un dirigible con la ayuda de una banda de piratas del cielo liderada por Dola, Sheeta acaba cruzándose con Pazu, un aprendiz de mecánico que ha pasado años persiguiendo la leyenda en la que una vez creyó su padre. Juntos atraviesan minas, rutas aéreas y fortalezas militares mientras tratan de entender por qué Laputa sigue despertando codicia, temor y asombro.
A medida que la persecución se cierra sobre ellos, la película combina una aventura aérea con una historia sobre la confianza y el valor. El sueño de Pazu de encontrar el castillo le ofrece a Sheeta un lugar donde apoyarse, mientras que el vínculo de Sheeta con el cristal empuja a ambos hacia la verdad oculta sobre las nubes. Laputa: El castillo en el cielo sigue siendo una fantasía de gran aliento sobre la tecnología perdida, las leyendas vivas y la elección entre el poder y la conservación.