Btooom! sigue a Ryouta Sakamoto, un joven desempleado que aún vive con su madre y cuya única notoriedad es ser el mejor jugador de Japón del popular juego en línea Btooom!. Esa habilidad se convierte en una maldición cuando despierta abandonado en una isla remota, con un cristal verde incrustado en la mano izquierda y sin recordar cómo llegó allí. Pronto descubre que el juego que dominaba ha sido recreado en la realidad y que ahora sus reglas tienen un precio mortal.
Cada participante recibe una bolsa de explosivos llamados “BIM”, y la única forma de volver a casa es matar a otros siete jugadores y arrebatarles sus cristales verdes. Ryouta se resiste al principio a recurrir a la violencia, pero la supervivencia lo obliga enseguida a adaptarse, ya que los demás jugadores de la isla resultan mucho más peligrosos de lo que esperaba. Finalmente se alía con Himiko, otra jugadora de Btooom!, y ambos intentan escapar juntos de la isla mientras van reconstruyendo la verdad detrás del concurso. A medida que se adentran en el misterio, Btooom! se convierte en una tensa lucha por la supervivencia sustentada en alianzas inestables, una confianza cambiante y la lógica brutal de un juego que ya no tiene nada de virtual.
