Brothers Conflict se centra en Ema Hinata, una joven de gran corazón que siempre ha vivido solo con su padre. Cuando él anuncia que se volverá a casar con Miwa Asahina, una exitosa diseñadora de moda, Ema se encuentra de pronto formando parte de una extensa familia nueva y de una casa llena de 13 hermanastros. Contenta de que su padre vaya a tener por fin un lugar propio y con el deseo de dar espacio a los recién casados, se muda a Sunrise Residence, donde viven los hermanos Asahina y donde su vida cotidiana pronto se vuelve mucho más complicada de lo que esperaba.
A medida que Ema se instala, descubre que el calor que tanto ha deseado quizá no sea tan sencillo como imaginaba. Varios de sus nuevos hermanos empiezan a tratarla con sentimientos que ya no son solo familiares, y el ambiente en la casa oscila entre el afecto, la rivalidad y una tensión contenida. Rodeada de hermanos que intentan ganar su atención de distintas maneras, Ema debe enfrentarse al caos emocional de su nuevo hogar mientras trata de entender cuál es su lugar. Brothers Conflict sigue ese delicado equilibrio entre los lazos familiares y el enredo romántico, encaminándose hacia la cuestión de si Ema podrá mantener la armonía entre todos ellos o elegir al único hermano que ha conquistado su corazón.
