Boarding School Juliet transcurre en la Academia Dahlia, donde los estudiantes de la Nación Oriental de Touwa y del Principado de Occidente conviven a pesar de una disputa que dura desde hace generaciones. Dentro de la escuela, los «Perros Negros» y los «Gatos Blancos» mantienen viva esa rivalidad, y se espera que sus respectivos líderes de dormitorio, Romio Inuzuka y Juliet Persia, se sitúen en bandos opuestos.
Lo que nadie a su alrededor sabe es que Romio y Juliet ya están enamorados. Cada día en la academia les obliga a equilibrar sus sentimientos con la presión de sus dormitorios, sus compañeros y la frágil paz que evita que la escuela derive en un conflicto abierto. Su relación secreta complica incluso los momentos más ordinarios, porque ser pareja en privado mientras fingen ser enemigos en público los expone a riesgos constantes, oportunidades perdidas y una tensión cada vez mayor.
A medida que su vínculo se fortalece, ambos se ven obligados a decidir si es realmente posible ocultarlo para siempre o si su amor solo podrá sobrevivir si están dispuestos a desafiar la disputa que divide a la Academia Dahlia y al mundo que la rodea.